RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 VCX2Q9H322 139 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TOMM6Q96B49 74 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 SPXQ9BT56 116 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 F8VRH5 84 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 SFTA2Q6UW10 78 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 OR11H2Q8NH07 326 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C3orf56Q8N813 242 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFA7O95182 113 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0J9YXV3 536 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C11orf86A6NJI1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 HIST1H4GQ99525 98 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 NXPH4O95158 308 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0U1RRA0 63 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TSHBP01222 138 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 PMVKQ15126 192 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0J9YY99 117 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF815PA8K554 130 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 CST9LQ9H4G1 147 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 PLNP26678 52 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 K7ERJ3 54 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 A8MZ25 164 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM262E9PQX1 116 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 K7ERU9 68 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 NPC2P61916 151 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 IGIPA6NJ69 53 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS2P07478 247 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS47A8MTI9 375 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 H3BUT2 72 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 RHODO00212 210 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE10A6NGK3 116 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2L6O14933 153 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 FGF6P10767 208 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE6Q13070 117 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 H7C2G1 150 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 FXYD2P54710 66 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 HERVK_113P61574 105 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZUT4 128 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 APOMO95445 188 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00694P0DN24 101 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 SPINK8P0C7L1 97 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 C16orf74Q96GX8 76 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 K7EQD1 137 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM141Q96I45 108 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 RS1O15537 224 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01546A6NGU7 62 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-216ENST00000524481 ZMAT4Q9H898 229 aa8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms