RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 RHOHQ15669 191 aa14.57□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 GYPEP15421 78 aa14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 ORMDL3Q8N138 153 aa14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 PRELID3AQ96N28 172 aa14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 NIT2Q9NQR4 276 aa14.56□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 TNFRSF6BO95407 300 aa14.55□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 PPBPP02775 128 aa14.55□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE12JA6NER3 117 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 H3BNG1 76 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 H7C1H1 209 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE1Q13065 139 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE4Q13068 117 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE5Q13069 117 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE13Q4V321 117 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.54□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 A0A096LPF7 62 aa14.53□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2D3P61077 147 aa14.53□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2D2P62837 147 aa14.53□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.53□□□□□ -0.08
CSAG3-202ENST00000617158 SRIP30626 198 aa14.52□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.52□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.51□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.51□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 PRSS47A8MTI9 375 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 IGLL5B9A064 214 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 MUC7Q8TAX7 377 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 IQCJQ1A5X6 159 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 ST20Q9HBF5 79 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 C20orf78Q9BR46 151 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 APLNQ9ULZ1 77 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 NUPR2A6NF83 97 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R17O96001 155 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 NUDT3O95989 172 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.45□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.45□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.45□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.45□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BKO60814 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 TSHBP01222 138 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BJP06899 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BOP23527 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BBP33778 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BDP58876 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BCP62807 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 VCYO14598 125 aa14.42□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 ESRGQ1W209 222 aa14.42□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.42□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00310P59036 64 aa14.41□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 Q8N8P6 123 aa14.41□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 LINC01546A6NGU7 62 aa14.4□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 I3L3M4 83 aa14.4□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 PMCHP20382 165 aa14.4□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 Q0VG73 95 aa14.4□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.4□□□□□ -0.1
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf196B1AJZ1 125 aa14.39□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 TCAPO15273 167 aa14.39□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.39□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 TIRAPP58753 221 aa14.38□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 CASC10Q5T4H9 136 aa14.38□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 NUPR1O60356 82 aa14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms