RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOKQ9Y6D0 94 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 COL7A1Q02388 2944 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SPINK13Q1W4C9 94 aa18.64■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 EDA2RQ9HAV5 297 aa18.64■□□□□ 0.58
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BMM0 161 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 VCYO14598 125 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC11AP67812 179 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 FHL3Q13643 280 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 Q8N1Y9 231 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DYNLRB2Q8TF09 96 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SUMO4Q6EEV6 95 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CSTL1Q9H114 145 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C1H1 209 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB114Q30KQ6 69 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SCGB3A1Q96QR1 104 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 HIGD1BQ9P298 99 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 COX11Q9Y6N1 276 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAH9Q9NYC9 4486 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB131AP59861 70 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ERASQ7Z444 233 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 F8VRH5 84 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD52Q0P140 79 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM61Q8N0U2 210 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf66Q6UXQ4 117 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 B9D2Q9BPU9 175 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 MDFICQ9P1T7 246 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC4Q99102 2169 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRY2O43597 315 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV3-20P01619 116 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM97Q5BJF2 176 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 KIR2DL4Q99706 377 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYGDP07320 174 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf66Q5T8R8 295 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CYSLTR1Q9Y271 337 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP6D1Q9H9H5 199 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOHQ15669 191 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM141Q96I45 108 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 KNCNA6PVL3 124 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 M0QY20 66 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM17AQ99595 171 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CBY3A6NI87 242 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 F5H697 171 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 NMUP48645 174 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP2Q6ZN57 461 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 JPT2Q9H910 190 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 TP73-AS1Q9UF72 201 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WWL8 130 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 SDHAF1A6NFY7 115 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF415Q09FC8 603 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF876PQ49A33 203 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NDN8 102 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 BAALCQ8WXS3 180 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MWV9 139 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TAX1BP3O14907 124 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SPXQ9BT56 116 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF56Q15929 161 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PCP2Q8IVA1 136 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 IGIPA6NJ69 53 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R2P5 195 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMY1CP0DJD4 496 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 INSL3P51460 131 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 INSP01308 110 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TAL2Q16559 108 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM74A4Q5TZK3 123 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GTSCR1Q86UQ5 136 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RHODO00212 210 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2V1Q13404 147 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM110AQ9BQ89 295 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS29PA6NIE9 313 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BRM9 83 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 I3L3M4 83 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 PMVKQ15126 192 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 NPSP0C0P6 89 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-204ENST00000587718 UFSP1Q6NVU6 142 aa18.43■□□□□ 0.54
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