RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 NRACQ8N912 160 aa10.07□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 VSIG2Q96IQ7 327 aa10.07□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 NIT2Q9NQR4 276 aa10.07□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 SMKR1H3BMG3 65 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 H3BNG1 76 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 RHOHQ15669 191 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 PRELID3AQ96N28 172 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 Q9UF83 564 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.06□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 PAX4O43316 350 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 NCR2O95944 276 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 P0DMU3 169 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 FAM231AP0DMU4 169 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 FAM231CP0DMU5 169 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 TNP2Q05952 138 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.04□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 PRSS47A8MTI9 375 aa10.04□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 TNFRSF6BO95407 300 aa10.04□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 NPYP01303 97 aa10.04□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 C20orf78Q9BR46 151 aa10.04□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.03□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 SRIP30626 198 aa10.03□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.03□□□□□ -0.8
SFTA3-201ENST00000418548 A0A0J9YY99 117 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 LINC00694P0DN24 101 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 GYPEP15421 78 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 ST20Q9HBF5 79 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa10.02□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 UBE2D3P61077 147 aa10.01□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 UBE2D2P62837 147 aa10.01□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 GAGE12JA6NER3 117 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 SDHAF1A6NFY7 115 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 GAGE1Q13065 139 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 GAGE4Q13068 117 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 GAGE5Q13069 117 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 GAGE13Q4V321 117 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 C18orf32Q8TCD1 76 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM70Q9BUB7 260 aa10□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 A0A096LPF7 62 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 NUPR2A6NF83 97 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 VCYO14598 125 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BKO60814 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BJP06899 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BOP23527 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BBP33778 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BDP58876 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BCP62807 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 Q0VG73 95 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 Q8N8P6 123 aa9.97□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.97□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.97□□□□□ -0.81
SFTA3-201ENST00000418548 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 IGLL5B9A064 214 aa9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 I3L3M4 83 aa9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 PMCHP20382 165 aa9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 MUC7Q8TAX7 377 aa9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 LINC01546A6NGU7 62 aa9.95□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 IQCJQ1A5X6 159 aa9.95□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.95□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.95□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.94□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 K7EMI3 77 aa9.94□□□□□ -0.82
SFTA3-201ENST00000418548 NUDT3O95989 172 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms