RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 KLLNB2CW77 178 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 H0Y8G0 127 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 H3BRM9 83 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 NXPH4O95158 308 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TGFAP01135 160 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 BLCAPP62952 87 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SCGB2A2Q13296 93 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 MAJINQ3KP22 176 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 MPV17L2Q567V2 206 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM29Q86T20 159 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM86BQ8N661 226 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RNF183Q96D59 192 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM141Q96I45 108 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 KIR2DL4Q99706 377 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ATRXP46100 2492 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PIEZO1Q92508 2521 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 F8VRH5 84 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LINC01619G3V211 115 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 H3BVH4 76 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3-11P01762 117 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM13P0DJ93 91 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CDKN1BP46527 198 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PTH2Q96A98 100 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TOMM6Q96B49 74 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 A0A0J9YX75 114 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CBY3A6NI87 242 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SMKR1H3BMG3 65 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 K7EP13 123 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 K7EQG2 157 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 NCR2O95944 276 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TFPI2P48307 235 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 NMUP48645 174 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CRYBA4P53673 196 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 HERVK_113P61574 105 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 MUC21Q5SSG8 566 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 Q8N2B8 174 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DCANP1Q8TF63 244 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 FOXC2Q99958 501 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 OR11H12B2RN74 326 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 K7ERU9 68 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TAX1BP3O14907 124 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRBV12-3P01733 135 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4-59P01825 116 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CD7P09564 240 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 FGF6P10767 208 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 FABP2P12104 132 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PMVKQ15126 192 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RHOHQ15669 191 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 OR11H1Q8NG94 326 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 OR11H2Q8NH07 326 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RASL10AQ92737 203 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 C18orf15Q96N68 181 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TIMM17AQ99595 171 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CSTL1Q9H114 145 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 AKAP6Q13023 2319 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-215ENST00000583289 ATMQ13315 3056 aa3.33□□□□□ -1.88
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