RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRACQ8N912 160 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRAP2Q96G30 205 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 NIT2Q9NQR4 276 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.95□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF415Q09FC8 603 aa12.95□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF876PQ49A33 203 aa12.95□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.95□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 AZU1P20160 251 aa12.95□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00315P59091 139 aa12.95□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTDAPP60985 99 aa12.94□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.94□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCGB1D1O95968 90 aa12.93□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.93□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.93□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASL10AQ92737 203 aa12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAB1Q9NY15 2570 aa12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 F5H697 171 aa12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0R2P5 195 aa12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRYGDP07320 174 aa12.91□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.91□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.91□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 C3orf79P0CE67 100 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSTL1Q9H114 145 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL6A5A8TX70 2615 aa12.89□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 LEPROTL1O95214 131 aa12.89□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF56Q15929 161 aa12.89□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8N8P6 123 aa12.89□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPXQ9BT56 116 aa12.89□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.88□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A096LNJ9 63 aa12.88□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRSS47A8MTI9 375 aa12.88□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa12.88□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTH2Q96A98 100 aa12.88□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.87□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.87□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCAPO15273 167 aa12.86□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC01546A6NGU7 62 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8N976 141 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 C20orf78Q9BR46 151 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 A8MWV9 139 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R17O96001 155 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTF3P20290 206 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRTAP10-11P60412 298 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL17DQ8TAD2 202 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 HBDP02042 147 aa12.84□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.84□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANK2Q01484 3957 aa12.84□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.83□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0QY20 66 aa12.83□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.83□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST20Q9HBF5 79 aa12.83□□□□□ -0.35
USP3-AS1-208ENST00000560962 NACAE9PAV3 2078 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRN3P1Q2M238 152 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 MDFIQ99750 246 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCER1GP30273 86 aa12.82□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 APOC4P55056 127 aa12.82□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAGE3Q14657 143 aa12.82□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.82□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 C16orf74Q96GX8 76 aa12.82□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0Y8G0 127 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 S100A12P80511 92 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFAF3Q9BU61 184 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 RS1O15537 224 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZTI0 123 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.81□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZSN1 163 aa12.8□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 P0DMU3 169 aa12.79□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM231AP0DMU4 169 aa12.79□□□□□ -0.36
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM231CP0DMU5 169 aa12.79□□□□□ -0.36
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