RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.59□□□□□ -1.19
GTPBP1-211ENST00000487538 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.59□□□□□ -1.19
GTPBP1-211ENST00000487538 NRACQ8N912 160 aa7.59□□□□□ -1.19
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01587Q99440 93 aa7.59□□□□□ -1.19
GTPBP1-211ENST00000487538 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
GTPBP1-211ENST00000487538 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.59□□□□□ -1.19
GTPBP1-211ENST00000487538 AGRNO00468 2067 aa7.58□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.58□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB125Q8N687 156 aa7.58□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 XCL2Q9UBD3 114 aa7.58□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.58□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01546A6NGU7 62 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 PRSS47A8MTI9 375 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 LEPROTL1O95214 131 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R17O96001 155 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 C3orf79P0CE67 100 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 HTN1P15515 57 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A12P80511 92 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N8P6 123 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.57□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087WWL8 130 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00315P59091 139 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF876PQ49A33 203 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 RASL10AQ92737 203 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 PTH2Q96A98 100 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 C20orf78Q9BR46 151 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 JPT2Q9H910 190 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.56□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 M0R2P5 195 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 HBDP02042 147 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N976 141 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 SPXQ9BT56 116 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 SORL1Q92673 2214 aa7.55□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 F5H697 171 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYGDP07320 174 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF56Q15929 161 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC4Q99102 2169 aa7.54□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 NOTCH1P46531 2555 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A096LNJ9 63 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 C20orf202A1L168 122 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MWV9 139 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 PRM2P04554 102 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 FCER1GP30273 86 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.53□□□□□ -1.2
GTPBP1-211ENST00000487538 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 PKIAP61925 76 aa7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 LAGE3Q14657 143 aa7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 PET117Q6UWS5 81 aa7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 IL17DQ8TAD2 202 aa7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 ST20Q9HBF5 79 aa7.52□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 TSTD3H0UI37 97 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EMI3 77 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 M0QY20 66 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 RHODO00212 210 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 AZU1P20160 251 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 VAMP8Q9BV40 100 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 CSTL1Q9H114 145 aa7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 H7C1H1 209 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 TCAPO15273 167 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLL1P15814 213 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFA6Q01524 100 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 C16orf74Q96GX8 76 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.5□□□□□ -1.21
GTPBP1-211ENST00000487538 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms