RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 Q86TA4 180 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 STHQ8IWL8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1B0GUT8 65 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 M0R2N4 97 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CAMPP49913 170 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MLANAQ16655 118 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 Q9H3A6 140 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 RABAC1Q9UI14 185 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 I3L2K1 104 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 K7EQM0 130 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 K7ERU9 68 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 RTL8CO15255 209 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 GNG7O60262 68 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 NUDT3O95989 172 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MIFP14174 115 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MAJINQ3KP22 176 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MPV17L2Q567V2 206 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CT45A10P0DMU9 189 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 PDE6HQ13956 83 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 VAMP3Q15836 100 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 ATOH7Q8N100 152 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 HSPG2P98160 4391 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV2-11P01706 119 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 PRR27Q6MZM9 219 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CST9LQ9H4G1 147 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 CELA1Q9UNI1 258 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 X6R8D5 127 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01546A6NGU7 62 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 KNCNA6PVL3 124 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 P0DMU3 169 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM231AP0DMU4 169 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM231CP0DMU5 169 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 GNG5P63218 68 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 A6NDN8 102 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BRM9 83 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLC1P0CG04 106 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 C12orf74Q32Q52 190 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BRN7 92 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 K7EQG2 157 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 ORM2P19652 201 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 MUC21Q5SSG8 566 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF575Q86XF7 245 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.43□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 FGF6P10767 208 aa8.43□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 PSG3Q16557 428 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 FA2HQ7L5A8 372 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf118A6NHY6 69 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 S100A7P31151 101 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 BLNKQ8WV28 456 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 HIGD1BQ9P298 99 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 GAGE12BA1L429 117 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PSG1P11464 419 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 DCANP1Q8TF63 244 aa8.41□□□□□ -1.06
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