RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598128.5

LINC00854-208, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-208	ENST00000598128	C5orf38	Q86SI9	138 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128		Q9UFV3	132 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128		H7C423	109 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	PF4	P02776	101 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	CTSG	P08311	255 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128		Q8TAT8	98 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128		U3KQE9	123 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	BCE1	O60756	84 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	ZNF56	Q15929	161 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	MIA	Q16674	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	RNF182	Q8N6D2	247 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TRIAP1	O43715	76 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	ELANE	P08246	267 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	EMP1	P54849	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	HERVK_113	P63121	156 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TCF15	Q12870	199 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	ADIPOQ	Q15848	244 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	GPHB5	Q86YW7	130 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	PRORY	Q9H606	182 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	MED13	Q9UHV7	2174 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	RNF223	E7ERA6	249 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	CCL8	P80075	99 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	DCANP1	Q8TF63	244 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	PLXNB1	O43157	2135 aa		6.22	□□□□□ -1.41
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM223B	A6NKX1	122 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	ODF3B	A8MYP8	253 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128		B9A039	149 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	COX7A2L	O14548	114 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	CNTFR	P26992	372 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128		Q6ZQT7	251 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128		Q8N6K4	173 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128		H3BUA1	57 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	LCE2B	O14633	110 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	NDUFC2	O95298	119 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	TSHB	P01222	138 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128		Q6ZS46	218 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	ZNF576	Q9H609	170 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	UTRN	P46939	3433 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	SERP2	Q8N6R1	65 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LINC00854-208	ENST00000598128	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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