RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OTORQ9NRC9 128 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DKK2Q9UBU2 259 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CUBNO60494 3623 aa4.26□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM250H0YL14 139 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VCYO14598 125 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHEK1O14757 476 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF253O75346 499 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EVI2AP22794 236 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CBLN1P23435 193 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LEPP41159 167 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MORN5Q5VZ52 161 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GATD1Q8NB37 220 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q9H3A6 140 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF586Q9NXT0 402 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.25□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf70A6NJV1 201 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H7BYZ3 331 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 J3KT08 172 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SFTA3P0C7M3 94 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FABP4P15090 132 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE2G1P62253 170 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM24BQ8N5W8 94 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM101Q96IK0 257 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF727A8MUV8 499 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BQ15 152 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BTX0 84 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R2Z0 102 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLC2P0DOY2 106 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP5G3P48201 142 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf195Q5TG92 126 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00477Q96M19 166 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DERL1Q9BUN8 251 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRN1Q9NPD7 142 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPDR1Q9UM22 224 aa4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEX7O00628 323 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFB4O95168 129 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD164Q04900 197 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PMVKQ15126 192 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BATFQ16520 125 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TVP23CQ96ET8 276 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.23□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JMJD1CQ15652 2540 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISLRO14498 428 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FMC1Q96HJ9 113 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C17orf77Q96MU5 243 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YPEL4Q96NS1 127 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARLQ9H300 379 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.22□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGTLC3B5MD39 225 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 J3QR89 54 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCRAP04437 139 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INSL3P51460 131 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-3P60369 221 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNG5P63218 68 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TDRG1Q3Y452 100 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCN12Q6JVE5 192 aa4.21□□□□□ -1.73
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.21□□□□□ -1.73
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