RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 FGF7P21781 194 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.83□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 Q8N976 141 aa6.83□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.82□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 LECT2O14960 151 aa6.82□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.82□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.81□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 MGST2Q99735 147 aa6.8□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.8□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.79□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.78□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.78□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.78□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 SEC11CQ9BY50 192 aa6.78□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.78□□□□□ -1.32
USP41-201ENST00000292729 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.78□□□□□ -1.32
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USP41-201ENST00000292729 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 FHITP49789 147 aa6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 Q6AWC8 147 aa6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 SUN5Q8TC36 379 aa6.77□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP41-201ENST00000292729 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.76□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 SVBPQ8N300 66 aa6.76□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 TREM1Q9NP99 234 aa6.76□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.76□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 RBAKDNA6NC62 111 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP41-201ENST00000292729 STAG3L2P0CL84 134 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 STAG3L3P0CL85 134 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 BCL2P10415 239 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 ZNF726P1Q15940 193 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 C14orf177Q52M58 125 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 MIC13Q5XKP0 118 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 RAB24Q969Q5 203 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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