RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 A8MWV9 139 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TMEM262E9PQX1 116 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 LINC01619G3V211 115 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 FGF6P10767 208 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ZNF876PQ49A33 203 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 AJUBAQ96IF1 538 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RHODO00212 210 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 BAALCQ8WXS3 180 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ZMAT4Q9H898 229 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ERG28Q9UKR5 140 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 FXYD2P54710 66 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 NRACQ8N912 160 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 LINC01548A6NM66 108 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PRORYQ9H606 182 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 K7ERJ3 54 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 A0A096LNJ9 63 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 UBE2L6O14933 153 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 CKS1BP61024 79 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RASL10AQ92737 203 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 C20orf173Q96LM9 149 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 LEPROTO15243 131 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 SYNJ2BPP57105 145 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 F6UB75 175 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RBX1P62877 108 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 C5orf42Q9H799 3197 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 C11orf86A6NJI1 115 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 G3V4G9 280 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 INSP01308 110 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ACACAQ13085 2346 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 RNF152Q8N8N0 203 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 J3QQQ9 107 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TMEM101Q96IK0 257 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 ATXN8Q156A1 80 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 SPXQ9BT56 116 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHG4P01861 327 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 ZNF580Q9UK33 172 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TRBV12-3P01733 135 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 BLCAPP62952 87 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 STHQ8IWL8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 M0R2P5 195 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 LGALS9O00182 355 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YX75 114 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 DEFB131AP59861 70 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 CDSNQ15517 529 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WW49 117 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGLV1-40P01703 118 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-59P01825 116 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 H3BMG7 143 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 MED13LQ71F56 2210 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 KLLNB2CW77 178 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-201ENST00000264345 PRR9Q5T870 116 aa6.67□□□□□ -1.34
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