RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 NXPH4O95158 308 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 GATA3P23771 443 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 TMEM262E9PQX1 116 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 TSHBP01222 138 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CFC1BP0CG36 223 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CFC1P0CG37 223 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 Q6Q795 121 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 RNF182Q8N6D2 247 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 SVILO95425 2214 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PTH2Q96A98 100 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 RHODO00212 210 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ASIPP42127 132 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 GPHB5Q86YW7 130 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 AJUBAQ96IF1 538 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 A8MWV9 139 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 M0R1W7 72 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PRR9Q5T870 116 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C11orf86A6NJI1 115 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 P0DMU3 169 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 FAM231AP0DMU4 169 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 FAM231CP0DMU5 169 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 IGIPA6NJ69 53 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 B9A039 149 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 GAGE5Q13069 117 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 GAGE6Q13070 117 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 OOSP1A8MZH6 123 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-23P01764 117 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZQT7 251 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PPP1R17O96001 155 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PLCE1Q9P212 2302 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WW49 117 aa7.49□□□□□ -1.21
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HCG18-242ENST00000602319 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 A0A0B4J2C4 111 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 H3BVH4 76 aa7.49□□□□□ -1.21
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HCG18-242ENST00000602319 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.49□□□□□ -1.21
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HCG18-242ENST00000602319 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TMEM141Q96I45 108 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TIMM17AQ99595 171 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DL4Q99706 377 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PRTN3P24158 256 aa7.48□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.48□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 HERVK_113P61574 105 aa7.48□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.48□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YX75 114 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TEX29Q8N6K0 151 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 Q8N9W7 124 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 SOCS3O14543 225 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-33P01772 117 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 PMVKQ15126 192 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 ZNF876PQ49A33 203 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A20O43772 301 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 TIMD4Q96H15 378 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C20orf173Q96LM9 149 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.46□□□□□ -1.21
HCG18-242ENST00000602319 C15orf32Q32M92 178 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LINC00477Q96M19 166 aa7.46□□□□□ -1.22
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