RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 ZNF138P52744 262 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 SLC51BQ86UW2 128 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 C16orf74Q96GX8 76 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 DKK2Q9UBU2 259 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-225ENST00000551253 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 FAM74A7A6NL05 159 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 K7EQM0 130 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TCRAP04437 139 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PRM2P04554 102 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 AZU1P20160 251 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 RAB5CP51148 216 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 EMP1P54849 157 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 GNG5P63218 68 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 CD300CQ08708 224 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 BTN1A1Q13410 526 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 ZFP69Q49AA0 526 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PRR9Q5T870 116 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 Q6AWC8 147 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 Q8TAT8 98 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 EPDR1Q9UM22 224 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 LYRM9A8MSI8 78 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 HTN1P15515 57 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 SULT1A2P50226 295 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 UBE2G2P60604 165 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 ATG101Q9BSB4 218 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 SNURFLB1AK76 121 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 IGLV2-11P01706 119 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PPT1P50897 306 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 DAD1P61803 113 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TVP23CQ96ET8 276 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TREM1Q9NP99 234 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PSG8Q9UQ74 426 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 CBY3A6NI87 242 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 F6UZH7 168 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TEX46H3BTG2 121 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PEX7O00628 323 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 RGS13O14921 159 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PAGE4O60829 102 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 IFNA7P01567 189 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 HTN3P15516 51 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TCL1AP56279 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TDRG1Q3Y452 100 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 CST9LP1Q5W188 147 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 Q6ZQT7 251 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 PRNTQ86SH4 94 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 SGK494Q96LW2 274 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 MANBALQ9NQG1 85 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 A0A1B0GV50 99 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 ATP5G3P48201 142 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-225ENST00000551253 SMUG1Q53HV7 270 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms