RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 SULT1A1P50225 295 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 BCAP31P51572 246 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 TMED6Q8WW62 240 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 OR51M1Q9H341 326 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 CCSO14618 274 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 OR10J4P0C629 311 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 S100A11P31949 105 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 Q8N976 141 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 NAGKQ9UJ70 344 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 COX11Q9Y6N1 276 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-209ENST00000526080 DIRC3C9JPN6 131 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 CIDEAO60543 219 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 TOR2AQ5JU69 321 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 PAXXQ9BUH6 204 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 CSN1S1P47710 185 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 C5orf51A6NDU8 294 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 GGTLC3B5MD39 225 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 RANP62826 216 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 HBG1P69891 147 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 HBG2P69892 147 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ATP6V1FQ16864 119 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 IL15RAQ13261 267 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF876PQ49A33 203 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 STX12Q86Y82 276 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 TVP23CQ96ET8 276 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 INPP1P49441 399 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 PTH2Q96A98 100 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 RMI2Q96E14 147 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 KCNS1Q96KK3 526 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf85Q96MD7 179 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 F6UZH7 168 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 THAP6Q8TBB0 222 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ASB13Q8WXK3 278 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ATP5SQ99766 215 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 FAM25EA8MYX2 175 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 OR7C2O60412 319 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 RAB32Q13637 225 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZRU5 148 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 C2orf50Q96LR7 162 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 Q9UF83 564 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE12JA6NER3 117 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 S100A5P33763 92 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 S100A10P60903 97 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE1Q13065 139 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE4Q13068 117 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE5Q13069 117 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 GAGE13Q4V321 117 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 TRIQKQ629K1 86 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 NIT1Q86X76 327 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00479Q96M42 142 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WWC5 75 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 PARLQ9H300 379 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 TREM1Q9NP99 234 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 OTORQ9NRC9 128 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 LPAP08519 4548 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 NHLH2Q02577 135 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 HYLS1Q96M11 299 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 KLK12Q9UKR0 248 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms