RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC00869P0C866 280 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 PET100P0DJ07 73 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 NPPCP23582 126 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 HBG1P69891 147 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 HBG2P69892 147 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 AKR1C1Q04828 323 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 BAXQ07812 192 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ATP6V1FQ16864 119 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 PATE2Q6UY27 113 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC01551Q86U37 167 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 STX12Q86Y82 276 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 METTL26Q96S19 204 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 MGST2Q99735 147 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 GINS3Q9BRX5 216 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 FABP1P07148 127 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 CD7P09564 240 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 STAG3L3P0CL85 134 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF138P52744 262 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 TCF24Q7RTU0 167 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 C15orf56Q8N910 161 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 AQP10Q96PS8 301 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 WFDC1Q9HC57 220 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 RABAC1Q9UI14 185 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 HSPB11Q9Y547 144 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 A6NDN8 102 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF98A6NK75 572 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SMLR1H3BR10 107 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 H3BRN7 92 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 MPDU1O75352 247 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 HYPMO75409 117 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 CD5P06127 495 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ORM2P19652 201 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 FGF7P21781 194 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 BMI1P35226 326 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 MIC13Q5XKP0 118 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 DCANP1Q8TF63 244 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 A0A1B0GVG6 124 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 OR4C46A6NHA9 309 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 B2MP61769 119 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 RAB31Q13636 194 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 DEFB125Q8N687 156 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 B9D2Q9BPU9 175 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ARL6Q9H0F7 186 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 ARV1Q9H2C2 271 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 DOK5Q9P104 306 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 RFNGQ9Y644 331 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 NACAE9PAV3 2078 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 OR11H12B2RN74 326 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 C11orf94C9JXX5 98 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 OR5G3P0C626 314 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 PAFAH1B2P68402 229 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGAP1-210ENST00000480054 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms