RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	TCRA	P04437	139 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357		Q6AWC8	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357		Q8TAT8	98 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	ATP5G1	P05496	136 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	ATP5G3	P48201	142 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	AKAP14	Q86UN6	197 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-210	ENST00000580357	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357		F6UZH7	168 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	IFNA7	P01567	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	RAB5C	P51148	216 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GNG5	P63218	68 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	HTN3	P15516	51 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FHIT	P49789	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	PPT1	P50897	306 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	PRR9	Q5T870	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357		P0DMU3	169 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TCL1A	P56279	114 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	UBE2G2	P60604	165 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357		F5H768	121 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	SPX	Q9BT56	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GAGE7	O76087	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-210	ENST00000580357	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	PEX7	O00628	323 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	SPINK4	O60575	86 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357		Q6ZQT7	251 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-210	ENST00000580357	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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