RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545215.5

LDHA-223, Transcript of lactate dehydrogenase A, human

TSL 1 (best)

Gene LDHA, Length 1,340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LDHA-223	ENST00000545215	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TAAR5	O14804	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	GNG7	O60262	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PRH1	P02810	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	MFAP2	P55001	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR2F1	Q13607	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ZNF266	Q14584	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ZNF345	Q14585	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215		Q56UQ5	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215		F6UZH7	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PHOX2A	O14813	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	CST7	O76096	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OXT	P01178	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IFNA5	P01569	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR10J1	P30954	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	RND2	P52198	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	NDUFA6	P56556	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	CLINT1	Q14677	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TRGV9	Q99603	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ATP5S	Q99766	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IGLL5	B9A064	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215		G3V3Q6	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	NDUFA4	O00483	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	CTSG	P08311	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	GPR183	P32249	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR5I1	Q13606	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215		Q8WTZ3	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	DOK5	Q9P104	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	BMPR1B	O00238	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	BCL2L11	O43521	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	YIF1A	O95070	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	CD5	P06127	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	PRSS2	P07478	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	AKR1C3	P42330	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDHA-223	ENST00000545215		K7EMT4	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.6 ms