RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV3-20P01619 116 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 LEPP41159 167 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 APOC4P55056 127 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB135Q30KP9 77 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 PRNTQ86SH4 94 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 BAGE2Q86Y30 109 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 SGK494Q96LW2 274 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00479Q96M42 142 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 PARLQ9H300 379 aa8.29□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF727A8MUV8 499 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 C9JQL5 133 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV2-11P01706 119 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 AMBPP02760 352 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 CT45A10P0DMU9 189 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 GNG4P50150 75 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.28□□□□□ -1.08
UBE2B-208ENST00000511807 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 NUPR2A6NF83 97 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 C9JCJ5 164 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 LTAP01374 205 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 SFTA3P0C7M3 94 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN1BP46527 198 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZWC4 215 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 Q86TA4 180 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 Q8TAT8 98 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM12Q96EX1 92 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 DERL1Q9BUN8 251 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 BIN3Q9NQY0 253 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.27□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM218A2RU14 115 aa8.26□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 GPX1P07203 203 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CRISP2P16562 243 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 SMUG1Q53HV7 270 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CENPWQ5EE01 88 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 AMTNQ6UX39 209 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CSTL1Q9H114 145 aa8.26□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.26□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 NAT8Q9UHE5 227 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.24□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 M0R2Z0 102 aa8.24□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 FXYD7P58549 80 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 LCE2CQ5TA81 110 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf49Q96NF6 230 aa8.24□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 SEC11CQ9BY50 192 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.23□□□□□ -1.09
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UBE2B-208ENST00000511807 J3KRW8 73 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 INSP01308 110 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 OCC1Q8TAD7 63 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 XCL2Q9UBD3 114 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 GCGP01275 180 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV2-8P01709 118 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-208ENST00000511807 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.22□□□□□ -1.09
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