RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8TAT8 98 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 ODF3Q96PU9 254 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 BIN3Q9NQY0 253 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 OSTCQ9NRP0 149 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 V9GYV3 84 aa8.55□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 A8MTW9 85 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 TRGC2P03986 189 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 CT45A10P0DMU9 189 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 HLA-DRB4P13762 266 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 IL36BQ9NZH7 164 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.54□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 SORL1Q92673 2214 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 H3BMM0 161 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 TYMSP04818 313 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 CD7P09564 240 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 CRISP2P16562 243 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 BTF3L4Q96K17 158 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 C8orf49Q96NF6 230 aa8.53□□□□□ -1.04
SLC13A3-211ENST00000495082 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 KNCNA6PVL3 124 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 S100A6P06703 90 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 ASCL2Q99929 193 aa8.52□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 C5orf52A6NGY3 159 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 PHOX2AO14813 284 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF124Q15973 351 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 SMUG1Q53HV7 270 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 AMTNQ6UX39 209 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 KLLNB2CW77 178 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BKO60814 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BJP06899 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BOP23527 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BBP33778 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 LEPP41159 167 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BDP58876 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BCP62807 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 PRR27Q6MZM9 219 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 FRZBQ92765 325 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 NUDT11Q96G61 164 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 TSPOP30536 169 aa8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 CRIP1P50238 77 aa8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 TRGC1P0CF51 173 aa8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 STHQ8IWL8 128 aa8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV3-20P01619 116 aa8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 CDKN1BP46527 198 aa8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 UBE2CO00762 179 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 SH2D1AO60880 128 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 P01737 135 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 GPX1P07203 203 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 PRR9Q5T870 116 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 Q6AWC8 147 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8N1Y9 231 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.48□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 CT83Q5H943 113 aa8.47□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.47□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 DNHD1Q96M86 4753 aa8.47□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.47□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 C7orf71A4D174 169 aa8.47□□□□□ -1.05
SLC13A3-211ENST00000495082 M0R2Z0 102 aa8.47□□□□□ -1.05
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