RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459988.1

UBAP2-208, Transcript of ubiquitin associated protein 2, human

TSL 2

Gene UBAP2, Length 2,628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF329	Q86UD4	541 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988		Q8N9W7	124 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBAP2-208	ENST00000459988	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	CHEK1	O14757	476 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	NPFF	O15130	113 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TOMM40	O96008	361 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	ELANE	P08246	267 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SMIM6	P0DI80	62 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	CFHR3	Q02985	330 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GAGE1	Q13065	139 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	LYST	Q99698	3801 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	NIT2	Q9NQR4	276 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	PEX7	O00628	323 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GCG	P01275	180 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IGLV2-8	P01709	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	LYZ	P61626	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	ISLR	O14498	428 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	NDUFA6	P56556	154 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SLC35B1	P78383	322 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	RASL10A	Q92737	203 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SMIM12	Q96EX1	92 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988		V9GYV3	84 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988		H3BRN7	92 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	ERVFC1-1	P60608	527 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IFITM10	A6NMD0	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	OR5I1	Q13606	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	EPDR1	Q9UM22	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SLC17A3	O00476	420 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GNG7	O60262	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV1-69	P01742	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TENM2	Q9NT68	2774 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	PGP	A6NDG6	321 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988		H3BTX0	84 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	LEMD1	Q68G75	181 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988		Q6ZWC4	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	FMC1	Q96HJ9	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988		Q9H3A6	140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	OTOR	Q9NRC9	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	NDUFB8	O95169	186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IL4	P05112	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	IGLC2	P0DOY2	106 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	GNG5	P63218	68 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	BAGE2	Q86Y30	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	OR5R1	Q8NH85	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBAP2-208	ENST00000459988	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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