RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf78Q9BR46 151 aa16.78■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 H3BMM0 161 aa16.77■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.77■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2WQ96B02 151 aa16.77■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.77■□□□□ 0.28
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 F8W1H4 67 aa16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 PPDPFLQ8WWR9 84 aa16.77■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 PCNX1Q96RV3 2341 aa16.76■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNA2O75051 1894 aa16.76■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.76■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.76■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 K7EP34 96 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 K7EN84 100 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 SIVA1O15304 175 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 AZU1P20160 251 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA12Q9UI09 145 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 J3QLI3 93 aa16.75■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 IGLC7A0M8Q6 106 aa16.74■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.74■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS3O14543 225 aa16.74■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM243Q9BU79 118 aa16.74■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 TCF15Q12870 199 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 ETDBQ3ZM63 59 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 H3BUA1 57 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf53Q8IXP5 236 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 PRO1854Q9UHT4 67 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 K7EP13 123 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 RNF138Q8WVD3 245 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZSR3 168 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 WDR81Q562E7 1941 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 ATRXP46100 2492 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS7O75251 213 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 NPSP0C0P6 89 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 ELANEP08246 267 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 FGF6P10767 208 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 CEND1Q8N111 149 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPM0 123 aa16.7■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 K7EMI3 77 aa16.7■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 PSCAO43653 123 aa16.7■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0BQ99437 205 aa16.7■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 CDK2AP2O75956 126 aa16.7■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 J3QQQ9 107 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 DAD1P61803 113 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF747Q9BV97 191 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 RBAKDNA6NC62 111 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 PFN2P35080 140 aa16.69■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXDQ9BXN6 97 aa16.68■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 BOD1L2Q8IYS8 172 aa16.68■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf46C9J442 243 aa16.68■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 CFHR3Q02985 330 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 F5H768 121 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE7O76087 117 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE12FP0CL80 117 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE12GP0CL81 117 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE12IP0CL82 117 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 UTF1Q5T230 341 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 HERVK_113P63121 156 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 CR1LQ2VPA4 569 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 CTSZQ9UBR2 303 aa16.67■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.66■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 FAM120AOSQ5T036 256 aa16.66■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 MED13LQ71F56 2210 aa16.66■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf77Q96MU5 243 aa16.66■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 DKK2Q9UBU2 259 aa16.66■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD6Q86Y78 171 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DMBP28068 263 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 MORN5Q5VZ52 161 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3C1Q12789 2109 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 LHBP01229 141 aa16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CCSAP-201ENST00000284617 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.64■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 RHOHQ15669 191 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 201.2 ms