RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TMEM250H0YL14 139 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SOCS3O14543 225 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 IGLL1P15814 213 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EDN2P20800 178 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 CCL20P78556 96 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ICAM4Q14773 271 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 OR11H12B2RN74 326 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 UBE2G2P60604 165 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 HAGHQ16775 308 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 LINC00052Q96N35 136 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ATG101Q9BSB4 218 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EPDR1Q9UM22 224 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 DIRC3C9JPN6 131 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SLC17A3O00476 420 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TCRAP04437 139 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TFPI2P48307 235 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 PSMG4Q5JS54 123 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TOR2AQ5JU69 321 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ZNF738Q8NE65 137 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 LINC00477Q96M19 166 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 C17orf77Q96MU5 243 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 GGTLC3B5MD39 225 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 H3BTX0 84 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PEX7O00628 323 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ZNF688P0C7X2 276 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TAS2R60P59551 318 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C11orf52Q96A22 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 FMC1Q96HJ9 113 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 VWFP04275 2813 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TSPOP30536 169 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 AKR1C3P42330 323 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 DEFB131AP59861 70 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 CD81P60033 236 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 UBE2G1P62253 170 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 COMMD7Q86VX2 200 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 RNF182Q8N6D2 247 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SMIM12Q96EX1 92 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ODF3Q96PU9 254 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TREM1Q9NP99 234 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 BIN3Q9NQY0 253 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 AMBPP02760 352 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 HLA-DRB4P13762 266 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ATP5G3P48201 142 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 STHQ8IWL8 128 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 RARRES2Q99969 163 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 A0A0J9YX75 114 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C9JCJ5 164 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 M0R3E3 92 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ZNF138P52744 262 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.93□□□□□ -1.3
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