RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ASAH1	Q13510	395 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	GUK1	Q16774	197 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PFDN5	Q99471	154 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	CCS	O14618	274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	MPDU1	O75352	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	TAS2R60	P59551	318 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	S100A10	P60903	97 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	IL15RA	Q13261	267 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PSG3	Q16557	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	MGST2	Q99735	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474		M0R2Z0	102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PRAF2	O60831	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF253	O75346	499 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	CST7	O76096	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RLN2	P04090	185 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	CDKN1B	P46527	198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	DAD1	P61803	113 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RHOB	P62745	196 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	LINC01587	Q99440	93 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474		H7BYZ3	331 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	UPK1B	O75841	260 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	DEFA1	P59665	94 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	DEFA3	P59666	94 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	BAX	Q07812	192 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RAB32	Q13637	225 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	PDE6H	Q13956	83 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	OPCML	Q14982	345 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	RNF212	Q495C1	297 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	NMES1	Q9C002	83 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RCN1-208	ENST00000532474		E5RGE8	158 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RCN1-208	ENST00000532474		H3BQ15	152 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RCN1-208	ENST00000532474	SLC17A3	O00476	420 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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