RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470115.1

GTF3C2-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, human

TSL 5

Gene GTF3C2, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF3C2-209	ENST00000470115	AKAP14	Q86UN6	197 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115		G3V3Q6	166 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	INS	P01308	110 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	PRM2	P04554	102 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	RHOB	P62745	196 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	B2M	P61769	119 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115		H3BQ15	152 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	SLC17A3	O00476	420 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	CXCL2	P19875	107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF266	Q14584	549 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	HTN3	P15516	51 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	PFDN5	Q99471	154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTF3C2-209	ENST00000470115	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	AZU1	P20160	251 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	DAD1	P61803	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	LINC01587	Q99440	93 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	PFDN1	O60925	122 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TAAR5	O14804	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115		P0DMU3	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	HTN1	P15515	57 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TSPO	P30536	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	CDKN1B	P46527	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF345	Q14585	488 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	GUK1	Q16774	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115		A0A0D9SG52	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	CD300C	Q08708	224 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	C1QB	P02746	253 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TAS2R60	P59551	318 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	PYY	P10082	97 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
GTF3C2-209	ENST00000470115	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GTF3C2-209	ENST00000470115		M0R3E3	92 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GTF3C2-209	ENST00000470115	BCL2L11	O43521	198 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF253	O75346	499 aa		11.58	□□□□□ -0.56

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