RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 RFNGQ9Y644 331 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 ZFHX3Q15911 3703 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 GPX1P07203 203 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 C8orf88P0DMB2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 MFAP2P55001 183 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 ZZEF1O43149 2961 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM50AO95807 157 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM17P0DL12 118 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 TDRG1Q3Y452 100 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 PROK1P58294 105 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.23□□□□□ -1.25
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DDX39B-215ENST00000462256 GNG13Q9P2W3 67 aa7.23□□□□□ -1.25
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DDX39B-215ENST00000462256 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 SNURFLB1AK76 121 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 K7ERU9 68 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 CKS1BP61024 79 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 ID3Q02535 119 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 FBLN7Q53RD9 439 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZS46 218 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 ASCL2Q99929 193 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 CBLN1P23435 193 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2V1Q13404 147 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 NMSQ5H8A3 153 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 GLMPQ8WWB7 406 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM12Q96EX1 92 aa7.21□□□□□ -1.25
DDX39B-215ENST00000462256 MLANAQ16655 118 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 STPG4Q8N801 248 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TRGV9Q99603 122 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CST9LQ9H4G1 147 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 NRN1Q9NPD7 142 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 LAMA5O15230 3695 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SMPXQ9UHP9 88 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 PGPA6NDG6 321 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SNAI2O43623 268 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 PITX3O75364 302 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZRM9 215 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0G2JRQ6 117 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SERF2P84101 59 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WWC5 75 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 C15orf62A8K5M9 175 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TOMM40O96008 361 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 ORM1P02763 201 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 RUNX1Q01196 453 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 ICAM4Q14773 271 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 VCX2Q9H322 139 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 FCN3O75636 299 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CXorf1O96002 111 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 VAX2Q9UIW0 290 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 C2orf70A6NJV1 201 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 F5H697 171 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 M0QXV9 152 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV2-23P01705 113 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SEC11BP0C7V7 166 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM18Q96B42 140 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CYYR1Q96J86 154 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 FSHBP01225 129 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 PROP1O75360 226 aa7.18□□□□□ -1.26
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