RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635747.1

CLN6-210, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-210ENST00000635747 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.14□□□□□ -0.31
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CLN6-210ENST00000635747 ATP6V1FQ16864 119 aa13.14□□□□□ -0.31
CLN6-210ENST00000635747 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.14□□□□□ -0.31
CLN6-210ENST00000635747 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.14□□□□□ -0.31
CLN6-210ENST00000635747 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.14□□□□□ -0.31
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CLN6-210ENST00000635747 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.05□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 ASB13Q8WXK3 278 aa13.05□□□□□ -0.32
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CLN6-210ENST00000635747 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 ZNF253O75346 499 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 CDKN1BP46527 198 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 NHLH2Q02577 135 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 Q6ZNX1 250 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 OR5C1Q8NGR4 320 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.03□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 H3BQ15 152 aa13.03□□□□□ -0.32
CLN6-210ENST00000635747 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
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