RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	JTB	O76095	146 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	CXCL3	P19876	107 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	B2M	P61769	119 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	RYR3	Q15413	4870 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179		A8MTW9	85 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179		H3BTX0	84 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	MPC2	O95563	127 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	CLINT1	Q14677	625 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	PSG3	Q16557	428 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	LYST	Q99698	3801 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	MPDU1	O75352	247 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	PFDN5	Q99471	154 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179		H3BQ15	152 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	SLC17A3	O00476	420 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	PTTG1	O95997	202 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	NEU1	Q99519	415 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179		M0R2Z0	102 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	CXCL2	P19875	107 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	PET100	P0DJ07	73 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	RHOB	P62745	196 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PNKP-223	ENST00000629179	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	LY6G6C	O95867	125 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	EMP1	P54849	157 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179		Q6ZTC4	211 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	ATP5S	Q99766	215 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	AMBP	P02760	352 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PYY	P10082	97 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	FCN2	Q15485	313 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	GUK1	Q16774	197 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	MED28	Q9H204	178 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	INS	P01308	110 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	HBE1	P02100	147 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	PRM2	P04554	102 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	RYR2	Q92736	4967 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.5 ms