RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328	SELENOT	P62341	195 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	LCN15	Q6UWW0	184 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		Q8N6K4	173 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	LEAP2	Q969E1	77 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	LINC00479	Q96M42	142 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	MS4A10	Q96PG2	267 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	RBKS	Q9H477	322 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	C20orf202	A1L168	122 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		A6NDX4	124 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TCF21	O43680	179 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TMEM50A	O95807	157 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	HPRT1	P00492	218 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	MT-ND6	P03923	174 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	REG1A	P05451	166 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	PRRX1	P54821	245 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	RUNX1	Q01196	453 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		Q0VG73	95 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR4C12	Q96R67	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	PARL	Q9H300	379 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	FUT9	Q9Y231	359 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		A0A1W2PRD5	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		A0A1W2PRF3	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		A0A1W2PRM7	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF320	A2RRD8	509 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		H3BUX3	64 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	RAB29	O14966	203 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	MT-CO2	P00403	227 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-7	P01780	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	IL3RA	P26951	378 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	CD1B	P29016	333 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	CEACAM3	P40198	252 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	GNG10	P50151	68 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	RAB7A	P51149	207 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	LTC4S	Q16873	150 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	VWC2	Q2TAL6	325 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328		Q8N2B8	174 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NF1-223	ENST00000584328	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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