RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583658.1

LLGL2-222, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-222	ENST00000583658	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	COX7A2P2	O60397	106 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	CAV2	P51636	162 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	EMP1	P54849	157 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR20E	P86478	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR20C	P86479	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR20D	P86480	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR20B	P86481	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR20A	P86496	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658		P0DMU3	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	S100A11	P31949	105 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	CAMLG	P49069	296 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	IL15RA	Q13261	267 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658		Q6ZRG5	221 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LLGL2-222	ENST00000583658	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	TSPO	P30536	169 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	SULT1A1	P50225	295 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	HBG1	P69891	147 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	HBG2	P69892	147 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	STX12	Q86Y82	276 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	CST7	O76096	145 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	PFDN5	Q99471	154 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658		M0R2Z0	102 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	S100A10	P60903	97 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	RHOB	P62745	196 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	RAB32	Q13637	225 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	GUK1	Q16774	197 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	MPDU1	O75352	247 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	UPK1B	O75841	260 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	OPCML	Q14982	345 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	PRAF2	O60831	178 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF253	O75346	499 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	CDKN1B	P46527	198 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	DAD1	P61803	113 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LLGL2-222	ENST00000583658	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658		A6NHS1	94 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	TAS2R60	P59551	318 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	BAX	Q07812	192 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	RLN2	P04090	185 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC01587	Q99440	93 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	NMES1	Q9C002	83 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	FGF7	P21781	194 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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