RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 CXCL2P19875 107 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 CXCL3P19876 107 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 MORN5Q5VZ52 161 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF709Q8N972 641 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q8NAQ8 132 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 MED28Q9H204 178 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 X6R8D5 127 aa8.99□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 LCE6AA0A183 80 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 JTBO76095 146 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSG3Q16557 428 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 LCN15Q6UWW0 184 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 MBD2Q9UBB5 411 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSPB11Q9Y547 144 aa8.98□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 AGRNO00468 2067 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 HLA-DMBP28068 263 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 GUK1Q16774 197 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP5SQ99766 215 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 HRH4Q9H3N8 390 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.97□□□□□ -0.97
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 A8MTW9 85 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 H3BTX0 84 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFNA5P01569 189 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 AMBPP02760 352 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGLC2P0DOY2 106 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 RHOBP62745 196 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 FCN2Q15485 313 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 RGS21Q2M5E4 152 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEU1Q99519 415 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.96□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 H3BQ15 152 aa8.95□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.95□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 AMTNQ6UX39 209 aa8.95□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.95□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.95□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC17A3O00476 420 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 RFNGQ9Y644 331 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.94□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM189A5PLL7 270 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 M0R2Z0 102 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF253O75346 499 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 INSP01308 110 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 HBE1P02100 147 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 EMP1P54849 157 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 ASB13Q8WXK3 278 aa8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 C11orf94C9JXX5 98 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PYYP10082 97 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 BLNKQ8WV28 456 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 WFDC1Q9HC57 220 aa8.92□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDE6HQ13956 83 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 OXA1LQ15070 435 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms