RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 APOC4P55056 127 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SELENOTP62341 195 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PATE2Q6UY27 113 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 STX12Q86Y82 276 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 STHQ8IWL8 128 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 UHRF2Q96PU4 802 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RSG1Q9BU20 258 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 CSTL1Q9H114 145 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 FBXL17Q9UF56 701 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 MPC2O95563 127 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 CAMLGP49069 296 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 DEFB1P60022 68 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PLP1P60201 277 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 HBG1P69891 147 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 HBG2P69892 147 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 BAXQ07812 192 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 FGL1Q08830 312 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RAB31Q13636 194 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 FCN2Q15485 313 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 ATP6V1FQ16864 119 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 DEFB135Q30KP9 77 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 MIC13Q5XKP0 118 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 ZNF546Q86UE3 836 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 LINC00052Q96N35 136 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 MED28Q9H204 178 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 ARV1Q9H2C2 271 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 GAGE10A6NGK3 116 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 B5MCH6 92 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 H3BRN7 92 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SPRY2O43597 315 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 FGF7P21781 194 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 S100A7P31151 101 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 ID1P41134 155 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 GALR1P47211 349 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 CLINT1Q14677 625 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RGS21Q2M5E4 152 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 VWC2Q2TAL6 325 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 Q6ZWC4 215 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 C17orf77Q96MU5 243 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 COX7A2P2O60397 106 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 MORN5Q5VZ52 161 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 Q6ZRG5 221 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 THAP6Q8TBB0 222 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RNF183Q96D59 192 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 MBD2Q9UBB5 411 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SOCS3O14543 225 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 IGKV3-20P01619 116 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PET100P0DJ07 73 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PSMB3P49720 205 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 OPCMLQ14982 345 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 GPR82Q96P67 336 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-217ENST00000550044 F6UB75 175 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 H3BMM0 161 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ISLRO14498 428 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MEOX2P50222 304 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 FXYD7P58549 80 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 B2MP61769 119 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 OXA1LQ15070 435 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 Q5BKY6 102 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 S100A7AQ86SG5 101 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms