RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 S100ZQ8WXG8 99 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 C2orf50Q96LR7 162 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 C17orf77Q96MU5 243 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CCDC32Q9BV29 185 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 RNF126Q9BV68 326 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PKHD1P08F94 4074 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 M0R2Z0 102 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 COX7A2P2O60397 106 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CST7O76096 145 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 AMBPP02760 352 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 HTN1P15515 57 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 HTN3P15516 51 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 S100A10P60903 97 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PSG3Q16557 428 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 MGST2Q99735 147 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 DKK2Q9UBU2 259 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PKD1P98161 4303 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 INSP01308 110 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRM2P04554 102 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CXCL3P19876 107 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CAMLGP49069 296 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 DAD1P61803 113 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 AMTNQ6UX39 209 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LINC01587Q99440 93 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 A0A087X0K7 114 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 A8MTW9 85 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 P0DMU3 169 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FAM231AP0DMU4 169 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FAM231CP0DMU5 169 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 S100A11P31949 105 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 B2MP61769 119 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 HBG1P69891 147 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 HBG2P69892 147 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 BAXQ07812 192 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 RAB32Q13637 225 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 MIC13Q5XKP0 118 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LCN15Q6UWW0 184 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 STX12Q86Y82 276 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 BAP18Q8IXM2 172 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ENKURQ8TC29 256 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 H3BTX0 84 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 RLN2P04090 185 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SULT1A1P50225 295 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ASAH1Q13510 395 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PFDN5Q99471 154 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 IGSF23A1L1A6 192 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 DEFB130BP0DP73 79 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 DEFB130AP0DP74 79 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CXCL2P19875 107 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 AZU1P20160 251 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FGF7P21781 194 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CDKN1BP46527 198 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 OPCMLQ14982 345 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 OXA1LQ15070 435 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FCN2Q15485 313 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ATP6V1FQ16864 119 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 MORN5Q5VZ52 161 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FAM210BQ96KR6 192 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 NACAE9PAV3 2078 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms