RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	PPT1	P50897	306 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	PRR25	Q96S07	402 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730		A8MZ25	164 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	HBE1	P02100	147 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	CSN1S1	P47710	185 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	SULT1A2	P50226	295 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB131A	P59861	70 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-224	ENST00000534730	SOCS3	O14543	225 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	CD7	P09564	240 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	STH	Q8IWL8	128 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	MRAP	Q8TCY5	172 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	GCHFR	P30047	84 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730		Q8N1Y9	231 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	IFNA7	P01567	189 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	PYY	P10082	97 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	APOC4	P55056	127 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	PSG3	Q16557	428 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.37	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730		H3BQ15	152 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	OR10J4	P0C629	311 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PRE2	83 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730		K7EQM0	130 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2C	O00762	179 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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