RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 CYCSP99999 105 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 ATP6V1FQ16864 119 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 SLC17A3O00476 420 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 MPC2O95563 127 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 MIFP14174 115 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 CXCL3P19876 107 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 RPL29P47914 159 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 CNN1P51911 297 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 PSG9Q00887 426 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 Q6ZRG5 221 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 S100A7AQ86SG5 101 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 MFFQ9GZY8 342 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 SLC25A31Q9H0C2 315 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 MBD2Q9UBB5 411 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 NUPR2A6NF83 97 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 PTTG1O95997 202 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 AMTNQ6UX39 209 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 CELA1Q9UNI1 258 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-211ENST00000531385 A8MTW9 85 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 H3BQ15 152 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 M0R2Z0 102 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 JTBO76095 146 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 IGLC2P0DOY2 106 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PSG3Q16557 428 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 LCN15Q6UWW0 184 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PFDN5Q99471 154 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 FCN2Q15485 313 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 RNF24Q9Y225 148 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 HSPB11Q9Y547 144 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PRAC2D3DTV9 90 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 MPDU1O75352 247 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 EMP1P54849 157 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 BAP18Q8IXM2 172 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PET100P0DJ07 73 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PYYP10082 97 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 CXCL2P19875 107 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 RPL12P30050 165 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 Q6ZTC4 211 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 ATP5SQ99766 215 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 HRH4Q9H3N8 390 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PRM2P04554 102 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 RHOBP62745 196 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 WFDC1Q9HC57 220 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 RFNGQ9Y644 331 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 MED28Q9H204 178 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRU-211ENST00000531385 C12orf74Q32Q52 190 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 NEU1Q99519 415 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 LY6G6CO95867 125 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 INSP01308 110 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 BLNKQ8WV28 456 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 M0R3E3 92 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRU-211ENST00000531385 NDUFB4O95168 129 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms