RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFNA5	P01569	189 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXCL2	P19875	107 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	C4BPB	P20851	252 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPRM	Q9NS64	109 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0J9YX75	114 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131		A8MTW9	85 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BQ15	152 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131		F6UB75	175 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF182	Q8N6D2	247 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL17D	Q8TAD2	202 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSG3	Q16557	428 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	GUK1	Q16774	197 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF253	O75346	499 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF266	Q14584	549 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERC2	O95714	4834 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC17A3	O00476	420 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	RARRES2	Q99969	163 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.56	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BTX0	84 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		12.55	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFB4	O95168	129 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV3-20	P01619	116 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	PYY	P10082	97 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSG9	Q00887	426 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDE6H	Q13956	83 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZNX1	250 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	KMT2A	Q03164	3969 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0J9YWU9	116 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMLR1	H3BR10	107 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF503	Q96F45	646 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131		X6R8D5	127 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARPC5	O15511	151 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	M6PR	P20645	277 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP6V0C	P27449	155 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHOB	P62745	196 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	FXYD5	Q96DB9	178 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8NAQ8	132 aa		12.51	□□□□□ -0.41

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