RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490688.2

TTC23-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 23, humanhuman

TSL 2

Gene TTC23, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23-210ENST00000490688 PFDN5Q99471 154 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 NUDT15Q9NV35 164 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 AGPAT2O15120 278 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 TCRBP04435 133 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 CXCL3P19876 107 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PRR20EP86478 221 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PRR20CP86479 221 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PRR20DP86480 221 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PRR20BP86481 221 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PRR20AP86496 221 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PSG3Q16557 428 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 GUK1Q16774 197 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 AMTNQ6UX39 209 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 RNF182Q8N6D2 247 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 UHRF2Q96PU4 802 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC23-210ENST00000490688 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 M0R2Z0 102 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 HTN3P15516 51 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 S100A11P31949 105 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CDKN1BP46527 198 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CAMLGP49069 296 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 RNF212Q495C1 297 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 S100ZQ8WXG8 99 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 C16orf74Q96GX8 76 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 C2orf50Q96LR7 162 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 H7BYZ3 331 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CCSO14618 274 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 PLA2G10O15496 165 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CCNKO75909 580 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 SULT1A1P50225 295 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TAS2R60P59551 318 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 S100A10P60903 97 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 LINC01587Q99440 93 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ZNF253O75346 499 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 MPDU1O75352 247 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 BAXQ07812 192 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ATP6V1FQ16864 119 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 PATE2Q6UY27 113 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 BAP18Q8IXM2 172 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ENKURQ8TC29 256 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 C17orf77Q96MU5 243 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 MGST2Q99735 147 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 CST7O76096 145 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 RLN2P04090 185 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ATP5G1P05496 136 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ATP5G3P48201 142 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 VWC2Q2TAL6 325 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ODF3Q96PU9 254 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 ATG101Q9BSB4 218 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TTC23-210ENST00000490688 IGLC2P0DOY2 106 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms