RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488270.1

HDAC10-215, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 3

Gene HDAC10, Length 715 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-215	ENST00000488270	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	PSG9	Q00887	426 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270		Q6ZRG5	221 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	NUPR2	A6NF83	97 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270		H3BQ15	152 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	MPC2	O95563	127 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	FGF7	P21781	194 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	B2M	P61769	119 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	BAX	Q07812	192 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-215	ENST00000488270	MPDU1	O75352	247 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	PTTG1	O95997	202 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	PSG3	Q16557	428 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	NEU1	Q99519	415 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270		H3BTX0	84 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	SLC17A3	O00476	420 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	CXCL2	P19875	107 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	CLINT1	Q14677	625 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	PFDN5	Q99471	154 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	CELA1	Q9UNI1	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	JTB	O76095	146 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	HSPB11	Q9Y547	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270		M0R2Z0	102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-215	ENST00000488270	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	FCN2	Q15485	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	ATP5S	Q99766	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	KMT2A	Q03164	3969 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	NDUFB4	O95168	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	PET100	P0DJ07	73 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	GUK1	Q16774	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270		Q6ZTC4	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF253	O75346	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	AMBP	P02760	352 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	PRM2	P04554	102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	PYY	P10082	97 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270		Q5BKY6	102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	MED28	Q9H204	178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDAC10-215	ENST00000488270	C11orf94	C9JXX5	98 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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