RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 CXCL2P19875 107 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 AZU1P20160 251 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 S100A7P31151 101 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 RAP2BP61225 183 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 IFITM3Q01628 133 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 ASAH1Q13510 395 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 H3BQ15 152 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 SCGB1D2O95969 90 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 HBE1P02100 147 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 OR5G3P0C626 314 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 OPCMLQ14982 345 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZR54 194 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF546Q86UE3 836 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.28□□□□□ -1.08
HDLBP-232ENST00000470482 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 IGSF23A1L1A6 192 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 PRAC2D3DTV9 90 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 SLC17A3O00476 420 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 GOSR2O14653 212 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 CST7O76096 145 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 EMP1P54849 157 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 B2MP61769 119 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RRN3P1Q2M238 152 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.27□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 NACAE9PAV3 2078 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RTL8CO15255 209 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 P0DMU3 169 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FAM231AP0DMU4 169 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FAM231CP0DMU5 169 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 SULT1A1P50225 295 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RAB32Q13637 225 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 KIR3DS1Q14943 382 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 MIC13Q5XKP0 118 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 BAP18Q8IXM2 172 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RNF24Q9Y225 148 aa8.26□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 LYRM9A8MSI8 78 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 H0YIZ8 118 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFB4O95168 129 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 S100A11P31949 105 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 CAMLGP49069 296 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FGL1Q08830 312 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 LCN15Q6UWW0 184 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 S100A7AQ86SG5 101 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF738Q8NE65 137 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 C5orf51A6NDU8 294 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF253O75346 499 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 UPK1BO75841 260 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 INSP01308 110 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 TAS2R60P59551 318 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF846Q147U1 533 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RNF212Q495C1 297 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 S100ZQ8WXG8 99 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.24□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FAM25EA8MYX2 175 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 L7N2F9 121 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 CT45A10P0DMU9 189 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 CDKN1BP46527 198 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 CAV2P51636 162 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 VAMP2P63027 116 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 FCN2Q15485 313 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 ATP6V1FQ16864 119 aa8.23□□□□□ -1.09
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.23□□□□□ -1.09
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