RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	S100A7	P31151	101 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR20E	P86478	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR20C	P86479	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR20D	P86480	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR20B	P86481	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR20A	P86496	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SNHG11-208	ENST00000437028	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	PLP1	P60201	277 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	PFDN5	Q99471	154 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028		U3KQE9	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	NRN1	Q9NPD7	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028		X6R8D5	127 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	MB	P02144	154 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SERF2	P84101	59 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028		Q6ZTC4	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF24	Q9Y225	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1W2PPV4	95 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	M6PR	P20645	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB2A	P61019	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG11-208	ENST00000437028	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028		H3BRN7	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	BUB3	O43684	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	RHOB	P62745	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	AMBP	P02760	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms