RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 MBD2Q9UBB5 411 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 A8MTW9 85 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SLC17A3O00476 420 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 IGLC2P0DOY2 106 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 S100A7P31151 101 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RAB31Q13636 194 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RPRMQ9NS64 109 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 LCE6AA0A183 80 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CXorf65A6NEN9 183 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PRAC2D3DTV9 90 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PSG9Q00887 426 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 Q5BKY6 102 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZRG5 221 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC1Q9HC57 220 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 HSPB11Q9Y547 144 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RFNGQ9Y644 331 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 KMT2AQ03164 3969 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 MIFP14174 115 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PSG3Q16557 428 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF738Q8NE65 137 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 MFFQ9GZY8 342 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CELA1Q9UNI1 258 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 MPDU1O75352 247 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PRM2P04554 102 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PYYP10082 97 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 PFDN5Q99471 154 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5SQ99766 215 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 MED28Q9H204 178 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 HRH4Q9H3N8 390 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 M0R2Z0 102 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFB4O95168 129 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CXCL2P19875 107 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 OXA1LQ15070 435 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 LCN15Q6UWW0 184 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 S100A7AQ86SG5 101 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 PET100P0DJ07 73 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 KIR3DS1Q14943 382 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 BAP18Q8IXM2 172 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 NEU1Q99519 415 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 RNF24Q9Y225 148 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 NUPR2A6NF83 97 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 G3V3Q6 166 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 M0R3E3 92 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 RGS21Q2M5E4 152 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf74Q32Q52 190 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZTC4 211 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF503Q96F45 646 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.7□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.69□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 EMP1P54849 157 aa7.69□□□□□ -1.18
ATG4B-210ENST00000428861 RHOBP62745 196 aa7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms