RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM210AQ96ND0 272 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OSTCQ9NRP0 149 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTTG3PQ9NZH4 202 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAJB9Q9UBS3 223 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFT172Q9UG01 1749 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 F8VRH5 84 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DAD1P61803 113 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAFAH1B2P68402 229 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LPCAT3Q6P1A2 487 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GDAP1Q8TB36 358 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CST11Q9H112 138 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATG5Q9H1Y0 275 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DMAC2Q9NW81 257 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ERGIC3Q9Y282 383 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM189A5PLL7 270 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 J3KT08 172 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCRL2O00421 344 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NEMFO60524 1076 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SERPINE1P05121 402 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYL2P10916 166 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNNI1P19237 187 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHBP35232 272 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB5CP51148 216 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FADDQ13158 208 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C4orf33Q8N1A6 199 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRC18Q8N456 261 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLHC1Q8NHS4 586 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ROPN1LQ96C74 230 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYH7P12883 1935 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSME4Q14997 1843 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VPS13CQ709C8 3753 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A1W2PRQ8 180 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HUS1O60921 280 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MT-ATP6P00846 226 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BOP23527 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BBP33778 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BDP58876 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VSNL1P62760 191 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BCP62807 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DYNLT1P63172 113 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST3H3Q16695 136 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST2H2BEQ16778 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C11orf88Q6PI97 169 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AKAP14Q86UN6 197 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C20orf196Q8IYI0 205 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q8N8P6 123 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR4B1Q8NGF8 309 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BHQ93079 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLAMF6Q96DU3 332 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HYLS1Q96M11 299 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCTD7Q96MP8 289 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BNQ99877 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST1H2BMQ99879 126 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STMN3Q9NZ72 180 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HBZP02008 142 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HNMTP50135 292 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM122BQ7Z309 247 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PARP14Q460N5 1801 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CEP250Q9BV73 2442 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BBIP1A8MTZ0 92 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TBCAO75347 108 aaKnown RBP-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFNW1P05000 195 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNP1P09430 55 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIGPP57054 158 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POU6F1Q14863 301 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPCS2Q15005 226 aa-4.48□□□□□ -3.13
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-4.48□□□□□ -3.13
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