RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 BPY2O14599 106 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 ORC5O43913 435 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 RBBP9O75884 186 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 SULT1C4O75897 302 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGLV3-1P01715 115 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 APOA2P02652 100 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 APCSP02743 223 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 C8orf88P0DMB2 117 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CCL1P22362 96 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 S100A5P33763 92 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 LINC00311Q8N616 119 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 Q8N6K4 173 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 TMEM106AQ96A25 262 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FBXL15Q9H469 300 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 OR5H14A6NHG9 310 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 M0R036 132 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 SULT1B1O43704 296 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 PDCD6O75340 191 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CA2P00918 260 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGLV2-8P01709 118 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CD7P09564 240 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 GTF2F2P13984 249 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 TCTAP57738 103 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DSCR10P59022 87 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FXYD3Q14802 87 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 KISS1Q15726 138 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 MPV17LQ2QL34 196 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DEFB135Q30KP9 77 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 PIGYQ3MUY2 71 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DEFB107AQ8IZN7 70 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 GALMQ96C23 342 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 USMG5Q96IX5 58 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 THTPAQ9BU02 230 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FAM107BQ9H098 131 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CKLFQ9UBR5 152 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 JPT1Q9UK76 154 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGLL5B9A064 214 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 C11orf94C9JXX5 98 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 H0YJW9 148 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 SCO1O75880 301 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IFNA5P01569 189 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 MAS1P04201 325 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CBX5P45973 191 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 ATP5G2Q06055 141 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 TNFRSF9Q07011 255 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 ZNF79Q15937 498 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 Q6P435 159 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 PXT1Q8NFP0 134 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 OR4K15Q8NH41 348 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 OR52N1Q8NH53 320 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DTD1Q8TEA8 209 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 PTH2Q96A98 100 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 OR2A7Q96R45 310 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 FAM223BA6NKX1 122 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 J3QLW9 94 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 NDUFA3O95167 84 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 DHFRP00374 187 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-201ENST00000358813 IGKV1D-12P01611 117 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.8 ms