RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637266.2

SCN2A-215, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,610 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCN2A-215	ENST00000637266	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	TFPI2	P48307	235 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	UBE2E1	P51965	193 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	TMEM89	A2RUT3	159 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	IGHV1-46	P01743	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266		K7EM74	188 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	CXCL1	P09341	107 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	GGN	Q86UU5	652 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	WFDC1	Q9HC57	220 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	SBF1	O95248	1867 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	RAMP3	O60896	148 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	CXCL5	P42830	114 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SCN2A-215	ENST00000637266	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		Q6P435	159 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		C9JQL5	133 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	FOXF2	Q12947	444 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		A0A0A6YYD4	124 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TIMM23	O14925	209 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	LINC00158	P58513	81 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	HIGD1B	Q9P298	99 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	IGKV1-5	P01602	117 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	IGHV2-70	P01814	119 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	VWC2	Q2TAL6	325 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	GFI1	Q99684	422 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	PLAUR	Q03405	335 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		Q8NFD4	153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	LIME1	Q9H400	295 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		E9PQ18	207 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TIAF1	O95411	115 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	MDS2	Q8NDY4	140 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	NDUFC2	O95298	119 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	APOC4	P55056	127 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		A0A1W2PRD5	423 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		A0A1W2PRF3	423 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		A0A1W2PRM7	423 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	C5orf63	A6NC05	138 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	PAX4	O43316	350 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		F8VRH5	84 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	NCR2	O95944	276 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	APELA	P0DMC3	54 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	PAX9	P55771	341 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		A0A1B0GUS0	222 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	GAFA1	Q96PS6	74 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	KNL1	Q8NG31	2342 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	FCN3	O75636	299 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TRAC	P01848	142 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	ELANE	P08246	267 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	GLRX5	Q86SX6	157 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	CSTL1	Q9H114	145 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266		H3BRN7	92 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	CELA2A	P08217	269 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SCN2A-215	ENST00000637266	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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