RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636054.1

5_8S_rRNA.4-201, humanhuman

BASIC

Gene 5_8S_rRNA, Length 151 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.54□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.54□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RYR3Q15413 4870 aa8.54□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SPRY2O43597 315 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CAMLGP49069 296 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PSMB3P49720 205 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HBG1P69891 147 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HBG2P69892 147 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 MIC13Q5XKP0 118 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.53□□□□□ -1.04
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 A0A087X0K7 114 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 H3BMM0 161 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 C3orf84H3BNL1 204 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ISLRO14498 428 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 OR5G3P0C626 314 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HLA-DRB4P13762 266 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RAP2BP61225 183 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 BAXQ07812 192 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 OXA1LQ15070 435 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 FCN2Q15485 313 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ATP6V1FQ16864 119 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 STHQ8IWL8 128 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 GPR82Q96P67 336 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RSG1Q9BU20 258 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.52□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 A8MTW9 85 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RLN2P04090 185 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 GALR1P47211 349 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CASC10Q5T4H9 136 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 MBD2Q9UBB5 411 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HSPB11Q9Y547 144 aa8.51□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 F6UB75 175 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SPP1P10451 314 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 FGF7P21781 194 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 MEOX2P50222 304 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 THAP6Q8TBB0 222 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.5□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RYR2Q92736 4967 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 A0A0J9YWU9 116 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 COX7A2P2O60397 106 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 MPDU1O75352 247 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 PET100P0DJ07 73 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 IGLC2P0DOY2 106 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 HLA-DMBP28068 263 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 S100A7P31151 101 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ID1P41134 155 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 B2MP61769 119 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CLINT1Q14677 625 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RGS21Q2M5E4 152 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 Q5BKY6 102 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RNF182Q8N6D2 247 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ZNF709Q8N972 641 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 LINC00052Q96N35 136 aa8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 A0A0J9YX75 114 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 G3V3Q6 166 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 RAB31Q13636 194 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 AMTNQ6UX39 209 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 Q8NAQ8 132 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 C16orf92Q96LL3 132 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ATP5SQ99766 215 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 MED28Q9H204 178 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 WFDC1Q9HC57 220 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 X6R8D5 127 aa8.48□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 TENM2Q9NT68 2774 aa8.47□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 H3BQ15 152 aa8.47□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 SLC17A3O00476 420 aa8.47□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 CXCL2P19875 107 aa8.47□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.47□□□□□ -1.05
5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.8 ms