RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 M6PRP20645 277 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 S100A7P31151 101 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 S100A7AQ86SG5 101 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC51BQ86UW2 128 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAP18Q8IXM2 172 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PPV4 95 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H3BTX0 84 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPP1P10451 314 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STOML3Q8TAV4 291 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRR25Q96S07 402 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FUT9Q9Y231 359 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HELTA6NFD8 242 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF785A8K8V0 405 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR7C2O60412 319 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PYYP10082 97 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GALR1P47211 349 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHOBP62745 196 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MS4A6AQ9H2W1 248 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GP9P14770 177 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRTAP10-11P60412 298 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERF2P84101 59 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPRMQ9NS64 109 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1B0GV50 99 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MBP02144 154 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR10J4P0C629 311 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEC11BP0C7V7 166 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FHITP49789 147 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PAFAH1B2P68402 229 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM90A2PQ658T7 463 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SSX7Q7RTT5 188 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BLNKQ8WV28 456 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSPAN4O14817 238 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF688P0C7X2 276 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD81P60033 236 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KHDC3LQ587J8 217 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM24BQ8N5W8 94 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC20Q8TCA0 184 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR82Q96P67 336 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NRN1Q9NPD7 142 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4C46A6NHA9 309 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WIPF1O43516 503 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD7P09564 240 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAS2R45P59539 299 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF726P1Q15940 193 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LCN15Q6UWW0 184 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB24Q969Q5 203 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C17orf77Q96MU5 243 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PAXXQ9BUH6 204 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF24Q9Y225 148 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD5P06127 495 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C16orf92Q96LL3 132 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00052Q96N35 136 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR51M1Q9H341 326 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H3BQ15 152 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 K7EQG2 157 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC17A3O00476 420 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.5 ms