RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591547.5

RETREG3-211, Transcript of reticulophagy regulator family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene RETREG3, Length 564 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3-211ENST00000591547 ATP6V1FQ16864 119 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 TEPPQ6URK8 271 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 Q8WTZ3 238 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 MARC2Q969Z3 335 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 MGST2Q99735 147 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.16□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 K7EMT4 169 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 AGPAT2O15120 278 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 ARPC5O15511 151 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 DFFBO76075 338 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 LINC00869P0C866 280 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 RD3LP0DJH9 198 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 AKAP14Q86UN6 197 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 METTL26Q96S19 204 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 MFFQ9GZY8 342 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 CSTL1Q9H114 145 aa7.15□□□□□ -1.26
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 MPDU1O75352 247 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.272e-12■■■■□ 20
RETREG3-211ENST00000591547 SELENOTP62341 195 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 ST8SIA2Q92186 375 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 DOK5Q9P104 306 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RABAC1Q9UI14 185 aa7.14□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 CHEK1O14757 476 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 CRYBB3P26998 211 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 CAMLGP49069 296 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 PLP1P60201 277 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 B2MP61769 119 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 ZNF266Q14584 549 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 ZNF345Q14585 488 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 MIC13Q5XKP0 118 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 Q6ZTC4 211 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 VSIRQ9H7M9 311 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 WFDC1Q9HC57 220 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 SMPXQ9UHP9 88 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.13□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 OR4C46A6NHA9 309 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 H3BRN7 92 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 IFNA5P01569 189 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 NPPCP23582 126 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 HLA-DMBP28068 263 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 TCTAP57738 103 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 CD300CQ08708 224 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RAB31Q13636 194 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 GLMPQ8WWB7 406 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RNF2Q99496 336 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 RSG1Q9BU20 258 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 U3KQE9 123 aa7.12□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.11□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 A0A1W2PS18 150 aa7.11□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 HMSDA8MTL9 139 aa7.11□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 COX7A2P2O60397 106 aa7.11□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 C1QBP02746 253 aa7.11□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 OR5G3P0C626 314 aa7.11□□□□□ -1.27
RETREG3-211ENST00000591547 ORM2P19652 201 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms