RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	NHLH2	Q02577	135 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	BAX	Q07812	192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680		Q6ZRG5	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680		H0YIZ8	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	SOCS3	O14543	225 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	COX7A2P2	O60397	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	MPDU1	O75352	247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	MPC2	O95563	127 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	IL17D	Q8TAD2	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	FGF7	P21781	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680	MED28	Q9H204	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEURL4-208	ENST00000572680		H3BMM0	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PRR20E	P86478	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PRR20C	P86479	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PRR20D	P86480	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PRR20B	P86481	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PRR20A	P86496	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	FGL1	Q08830	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	OPCML	Q14982	345 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	RGS21	Q2M5E4	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PFDN5	Q99471	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	B2M	P61769	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	RARRES2	Q99969	163 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A087X0K7	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	CXCL3	P19876	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	CLINT1	Q14677	625 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A0J9YWU9	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	C4BPB	P20851	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	FCN2	Q15485	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	C20orf173	Q96LM9	149 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	DEFB1	P60022	68 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	ATP5S	Q99766	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A0J9YX75	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	CXCL2	P19875	107 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEURL4-208	ENST00000572680	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680		F6UB75	175 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680	IFNA5	P01569	189 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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