RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRR-209ENST00000549308 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRR-209ENST00000549308 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRR-209ENST00000549308 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRR-209ENST00000549308 SEC11CQ9BY50 192 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRR-209ENST00000549308 RNF114Q9Y508 228 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WW49 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1W2PRE2 83 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 F6UZH7 168 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 H3BTX0 84 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 PDE6DO43924 150 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 APOC3P02656 99 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 CRYBB3P26998 211 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GPHB5Q86YW7 130 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 CD28P10747 220 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM250H0YL14 139 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 H3BQ15 152 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 BUB3O43684 328 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 RANP62826 216 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 DPF1Q92782 380 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 U3KQE9 123 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF785A8K8V0 405 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01619G3V211 115 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 IGLC2P0DOY2 106 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB136Q30KP8 78 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GPR82Q96P67 336 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 HIVEP1P15822 2718 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1W2PRX2 142 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1W2PS18 150 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 PGPA6NDG6 321 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GGTLC3B5MD39 225 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 K7EMT4 169 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GALR1P47211 349 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 PROK1P58294 105 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 TM4SF20Q53R12 229 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 REC114Q7Z4M0 266 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 OR11H1Q8NG94 326 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 Q9H3A6 140 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SYNJ2BPP57105 145 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C1QL4Q86Z23 238 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C17orf77Q96MU5 243 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 PARLQ9H300 379 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 OTORQ9NRC9 128 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 MTORP42345 2549 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF727A8MUV8 499 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 LGALS9O00182 355 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFB4O95168 129 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SLURP1P55000 103 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GUCA2BQ16661 112 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SVBPQ8N300 66 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 GLMPQ8WWB7 406 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf52Q96A22 123 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 DUX3Q96PT4 197 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms