RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 OPCMLQ14982 345 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 S100A7AQ86SG5 101 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 STPG3Q8N7X2 389 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 GLMPQ8WWB7 406 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF222A6NCQ9 220 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 HELTA6NFD8 242 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNA5P01569 189 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ORM2P19652 201 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 B2MP61769 119 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PAFAH1B2P68402 229 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF266Q14584 549 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZRG5 221 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 TCF24Q7RTU0 167 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ARL6Q9H0F7 186 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 WFDC1Q9HC57 220 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 FBXL17Q9UF56 701 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF24Q9Y225 148 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4C46A6NHA9 309 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF98A6NK75 572 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 HMSDA8MTL9 139 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 H3BRN7 92 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 C1QBP02746 253 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 MIC13Q5XKP0 118 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PATE2Q6UY27 113 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF709Q8N972 641 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR82Q96P67 336 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ARV1Q9H2C2 271 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 DOK5Q9P104 306 aa6.44□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 TAAR5O14804 337 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 COX7A2P2O60397 106 aa6.43□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF345Q14585 488 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 HYLS1Q96M11 299 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PFDN5Q99471 154 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 MFFQ9GZY8 342 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 K7EQG2 157 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ARPC5O15511 151 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 UHRF2Q96PU4 802 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0D9SG52 128 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SPRY2O43597 315 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 TFPI2P48307 235 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 MEOX2P50222 304 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB135Q30KP9 77 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 LEMD1Q68G75 181 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A22Q9H936 323 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A087X0K7 114 aa6.4□□□□□ -1.38
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